Hey.
Dann versuch doch als erstes mal die Sichtprüfung der Klappenbewegung.
Deckel runter und dann Zündung an und den Selbsttest beobachten. Evtl zu zweit bzw mit ner Cam aufnehmen und dann vergleichen ob beide klappen synchron laufen. Dann noch ein zweites mal (wie du sagst, wenn dann kein fehler mehr kommt) und vergleichen ob an der Bewegung etwas anders ist als beim ersten mal.
Einen Schritt nach dem anderen.
Alternativen wären Fehler auslesen/löschen und Drosselklappen anlernen.
Mir fällt gerade ein...
Evtl hab ich es nur überlesen...
Megalagu hat es auch schon erwähnt!...
Hast du nach dem Tausch der Komponenten die Drosselklappen überhaupt angelernt? Wenn nicht kann das mit hoher Wahrscheinlichkeit der Fehler sein. Das Motorsteuergerät weis ja nicht das eine andere DK Einheit verbaut wurde und evtl jetzt andere Werte ausgibt.
Gruß Christian 
werde ich machen demnächst ,da bin ich schon gespannt !